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As for his lifetime project to write a history of the city of Porto, upon invitation by the municipal council in 1952, due to his health problems he was only able to create a tentative draft of the structure, which Damiao Peres and António Cruz returned to in his memory a decade later.
His historiographical legacy on the city of Porto and the medieval chronicles still remain as benchmarks for contemporary studies, for the quality of their scientific scholarship, the receptivity conquered in the general public, and his grasp of the importance of the media, such as the press, radio, and cultural associations in the dissemination and highlight of history. Luís de Pina provided the most deserved tribute in homage to the unequalled Porto historian: "His death to remain irreparable for generations to come, chief chronicler of Porto and high guardian of the Tower of all its tradition ... Magalhães Basto splendidly wrote the biography of his city, Porto, thereby amending or adding many pages to the history of Portugal" (Memor Beneficii, 1961, p. 5).
Works by the author : “A fronteira hispano-portuguesa (ensaio de geografia política)”, O Instituto: revista scientífica e literária, Coimbra, vol. 70.º, 1923, pp. 57-225; 1809: o Pôrto sob a segunda invasão francesa, Lisboa, Empresa Literária Fluminense, 1926; “Alguns documentos inéditos sôbre Uriel da Costa” e “Novo documento inédito sôbre Uriel da Costa”, O Instituto: revista scientífica e literária, Coimbra, vol. 79.º, 1930, pp. 1-20; História da Santa Casa da Misericórdia do Porto, 1ª ed, Porto, Santa Casa da Misericórdia, 1934; Relação ou crónica breve das cavalarias dos doze de Inglaterra, Porto, Imprensa Portugueza, 1935; "Vereaçoens": anos de 1390-1395, o mais antigo dos livros de Vereações do Município do Porto existentes no seu arquivo, Porto, Câmara Municipal do Porto, 1937; Fernão Lopes: suas crónicas perdidas e a crónica geral do reino, Porto, Progredior, 1943; Crónica de cinco reis de Portugal: inedito quatrocentista reproduzido do Cód. 886 da Biblioteca Públ. Municipal do Pôrto, seguido de capítulos inéditos da versão portuguesa da Crónica Geral de Espanha e outros textos, Porto, Civilização, 1945; Cronistas e crónicas antigas: Fernão Lopes e a “Crónica de 1419”, Coimbra, Imprensa da Universidade, 1959; Estudos Portuenses, 2 volumes, Porto, Biblioteca Pública Municipal do Porto, 1962-1963.
