A afirmação das primeiras ideias republicanas em Portugal face ao constante declínio da Monarquia Constitucional é outro dos pontos fortes evidenciados por Marques Gomes nesta obra. Outro dos aspectos evidentes que Marques Gomes retomou, como característica dos seus estudos históricos, foram as comemorações dos centenários de Camões em 1880 e do Marquês de Pombal em 1882. No tricentenário de Camões Marques Gomes viu o papel histórico de Portugal na marcha da civilização moderna e a sua epopeia de liberdade, fraternidade e progresso (pp. 505-507). No que diz respeito ao centenário do Marquês de Pombal, e ao contrário de que acontecera com Camões em 1880, coube ao governo a sua organização, tendo para o efeito, nomeado uma comissão presidida por Rodrigues Sampaio. O autor desenvolve uma interpretação historicista de Pombal apresentando-o à sociedade portuguesa do século XIX como um "(...) dos percursores do liberalismo e da própria democracia." (História da História em Portugal. Séculos XIX-XX, 1996, p. 623). Outro dos momentos históricos, de particular importância, evidenciados nesta obra por Marques Gomes é o Ultimatum Inglês de 1890. Este acontecimento político, que marcaria «o progresso da decadência» da Monarquia Constitucional, surgiu num contexto em que Portugal procurou definir as suas fronteiras em África e, para tal, desenhou um mapa onde ficariam unidos, sob administração portuguesa, os territórios de Angola e Moçambique e que foi aceite internacionalmente, mapa esse que ficou conhecido por «mapa cor-de-rosa».

Em suma esta participação de Marques Gomes no volume XII da História de Portugal, sob a direcção de Pinheiro Chagas, confirmou a importância da sua escrita histórica no panorama nacional fazendo figurar o seu nome entre os membros da Academia de Ciências de Lisboa. O seu olhar sobre a história nacional, tal como pela história e memória local, é claramente liberal, embora no último quartel do século XIX verifiquemos uma transição para a ideologia republicana. A construção deste olhar ideológico está bem patente nos conceitos que são empregues ao longo dos seus estudos. Conceitos como liberdade e progresso moral dos homens são muito utilizados nos estudos efectuados por Marques Gomes, dando lugar destacado à sua cidade natal (Aveiro), como baluarte da defesa desses princípios ao longo dos momentos de decadência vividos na história de Portugal e essa ideia de liberdade encontra pontos de contacto com Oliveira Martins (História de Portugal, s.d., p. 529).

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