A transição entre os anos 1960 e 1970 foram os que permitiram a Alexandre Lobato ter uma experiência docente. Começou na sua natal Lourenço Marques, leccionando como professor auxiliar a partir de 1968 as cadeiras sintomáticas da sua visão da história lusa, ou seja “História de Portugal” e “História da Expansão Portuguesa no Mundo”. Já depois do 25 de Abril, na Universidade que adoptaria o nome de Eduardo Mondlane, leccionou de 1974 até 1977 a cadeira de “História de Moçambique Colonial”. Na mesma altura, ocupou a função de Diretor interino do Arquivo Histórico de Moçambique. Em 1977, decidiu voltar a Portugal. Em Lisboa, foi Investigador Principal na Junta de Investigações Científicas do Ultramar, leccionou na Faculdade de Letras de Lisboa a cadeira de “História da Expansão Portuguesa no Mundo” e a mesma cadeira na Universidade Livre, de em 1980, seguindo nas mesmas temáticas. Faleceu em Lisboa em 1985, sempre ativo cientificamente. O percurso de Alexandre Lobato, esse historiador que só escreveu sobre o Império e que foi um incorruptível defensor da sua existência, não pôde resistir ao movimento de arrumação da História pós 25 de Abril. Até o lugar onde faleceu revela essa história que desvaneceu: é na antiga capital do já inexistente império que Alexandre Lobato morreu.

Bibliografia activa: História da Fundação de Lourenço Marques, Lisboa, Edições da Revista « Lusitânia », coleção Estudos Moçambicanos, 1948; História do Presídio de Lourenço Marques, 1782-1786, Vol 1, Lisboa, Estudos Moçambicanos, 1949; Aspectos de Moçambique, No antigo regime colonial, Lisboa, Livraria Portugal, 1953; A Expansão portuguesa em Moçambique de 1498 a 1530, Livro I, Descobrimento e ocupação da Costa, 1498-1508, Lisboa, Agência Geral do Ultramar, coleção « Estudos moçambicanos », 1954 ; Sociologia política da expansão e outros ensaios, Lisboa, Revista do Gabinete de Estudos Ultramarinos, Centro de Estudos Políticos e sociais da Junta de Investigadores do Ultramar, 1957; História do Presídio de Lourenço Marques, Livro II, 1787-1799, Lisboa, Junta de Investigação do Ultramar, Estudos Moçambicanos, 1960; A Expansão portuguesa em Moçambique de 1498 a 1530, Livro III, Aspectos e problemas da vida económica, de 1505 a 1530, Lisboa, Agência Geral do Ultramar, coleção « Estudos moçambicanos », 1960; Alexandre Marques LOBATO, Quatro Estudos e uma evocação para a história de Lourenço Marques, Lisboa, Junta de Investigações do Ultramar, colecção « Estudos Moçambicanos », 1961; Pequena história da Índia Portuguesa, Lisboa, Separata da revista Ultramar, n°7/8, 1962 ; Relações luso-maratas, 1658-1737, Lisboa, Centro de Estudos Históricos Ultramarinos, 1965.

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