Apesar de tais considerações, no ano seguinte, 1918, Afonso Costa é eleito por 9 votos e uma abstenção, a do presidente da classe Joaquim José Coelho de Carvalho, que “entendia que não devia preferir uma pessoa ainda estranha a ela [ACL], a alguns dos sócios correspondentes, e não por outra razão” (vol. XII, 1917-1918, p. 601).

Já no volume XII (1917-18) a dimensão do Boletim da Segunda Classe atinge as 599 páginas, a maioria das quais de análise e de transcrição de documentos. É perceptível a influência do publicista António Ferrão, com os seus estudos documentais bastante extensos, nos volumes finais desta série: XIX, XX (1ª parte) e XX (2ª parte), relativos a 1924-25 e 1926-1929, mas só impressos provavelmente depois de 1932 (dois não contêm indicação de data). No penúltimo tomo, Ferrão sugere a suspensão da publicação do Quadro Elementar (parada desde 1876) e a sua substituição por “uma colecção de instruções diplomáticas” e uma séria de alterações na publicação do Coripo Diplomático, interrompido há 62 anos. E, num exemplo dos seus ambiciosos projectos, refere a necessidade de uma missão portuguesa aos arquivos do Vaticano e criação “de um instituto histórico [português] em Roma dependente desta classe”. É mesmo nomeado para ir ao “estrangeiro”, de forma a reunir elementos que servissem de base para escrever uma História de Portugal (ambicionada na Academia das Ciências desde finais do século XVIII) e uma História da cultura portuguesa – projectos nunca concretizados (vol. XX (1ª parte), s.d., pp. 28-29 e 38). A impressão do Boletim é realizada em Lisboa, na ACL, nos primeiros cinco volumes, entre 1903 e 1912 (referentes a 1898-1911), no IX, de 1915 e nos dois finais (XX, 1ª e 2ª partes, s.d.). Os restantes, do VI-VIII (1913-1914) e VIII (1916) ao XIX (1933), vêem a luz do dia em Coimbra. O Boletim da Academia das Ciências, que sucederá ao Boletim da Segunda Classe, é impresso em Coimbra a partir de 1929 e passará para Lisboa, a partir de 1935. O Boletim da Segunda Classe só existiu, assim, in nomine, para completar a função de repositório de actas e pareceres, até 1929, coexistindo então com uma nova ou segunda série.

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