Não participou publicamente e em contraditório nas polémicas bem acesas na época, mas encontramo-lo emitindo doutrina sobre assuntos ou personagens em questão, ou, simplesmente, constatando o debate existente: sobre Damião de Góis e António Vieira perante a Inquisição (1938 e 1958); sobre Pombal, os jesuítas e a maçonaria (1965, 69 e 73); sobre o longo debate entre António José Saraiva e I. Revah sobre inquisição e cristãos-novos (1971). Também marcou a sua posição a respeito de alguma produção de José Sebastião da Silva Dias (1962) e de A. H. de Oliveira Marques (1973).

Sem dúvida que foi um homem atento às novidades relacionadas com a escrita da História. Assim, por exemplo, assinalou a edição e reedição da História da Igreja em Portugal, de Fortunato de Almeida (1934 e 1969); os Elementos da História de Portugal, de Alfredo Pimenta (1935); a História da Cultura e da Literatura Portuguesa, de Hernâni Cidade (1943), da obra de Jaime Cortesão Descobrimentos Portugueses (1959), o surgimento da Lusitânia Sacra (1957). Assinalou também a edição da História Eclesiástica de España (1933) e o início da colecção Biblioteca de Autores Cristianos (1948). A ele se deve a edição dos seis volumes da História de Portugal do jesuíta seu companheiro de exílio Luís Gonzaga de Azevedo (1935 a 1944).

Podemos dizer que Domingos Maurício escreveu história obedecendo a quatro ritmos, aliás frequentemente em conexão. O primeiro, será o produto do seu encontro com os arquivos das cidades onde a sua formação eclesiástica o levou, especialmente Roma e Florença, beneficiando do renovado interesse e organização dos arquivos da Igreja e outros. Efectivamente, é no Arquivo Secreto do Vaticano, na Biblioteca Vaticana e na Biblioteca Medicea-Laurenziana de Florença que recolheu material para os seus mais pioneiros e importantes trabalhos. Referimos os estudos sobre D. Duarte e a expedição a Tânger, sobre Nuno Álvares Pereira e sobre o infante D. Fernando: o cruzamento de documentação já conhecida com outra por ele descoberta, bem como a sua contextualização em vários planos da História “global” (de Portugal, da Península Ibérica, da Europa, do papado, do Islão) forjaram clássicos da nossa historiografia.

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