Em 1936 fez parte da comissão organizadora do I Congresso da História da Expansão Portuguesa no Mundo e da Comissão Orientadora da Exposição Histórica da Ocupação. Três anos depois passa à situação de reforma na marinha. Em 1950 é eleito vice-presidente da Federação Aeronáutica Internacional e quatro anos depois é convidado, pelo Coronel Pinheiro Corrêa, para fazer parte de uma comissão com vista à criação de um futuro Museu do Ar. Em Junho de 1958, é promovido na Assembleia Nacional, ao posto de Almirante com distinção.

Foi colaborador de numerosos periódicos, entre eles, os Anais do Club Militar Naval; Anais da Academia Portuguesa de História; Boletim da Sociedade de Geografia de Lisboa; Boletim da Academia das Ciências. O seu primeiro estudo histórico mais significativo seria O roteiro da viagem de Vasco da Gama e a sua versão nos Lusíadas, quando tinha 61 anos de idade, ainda que o primeiro artigo tenha sido sobre o dirigível inventado por Cipriano Jardim, publicado em 1889 quando o autor tinha apenas uns 20 anos e acabara de sair da Escola Naval. Concluiu que o conhecimento prático adquirido ao longo das viagens realizadas pelos portugueses foi crucial para o desenvolvimento da navegação astronómica, consequência da aglomeração de erros, quando se navegava por estima sem avistar terra. Confirmou, assim, que as viagens não eram fruto do acaso, mas delineadas e preparadas tendo em conta ventos e correntes marítimas, o que nem sempre correspondia à opinião historiográfica da época. Aproveitou para estudar melhor o regime dos ventos e correntes no Atlântico Norte que levava os mareantes lusos a proceder à designada por “volta do largo”, que na época dos Descobrimentos foi denominada “volta da Guiné” ou “volta da Mina”, por partirem da Guiné ou da Mina os navios que faziam a bordada em arco para noroeste, para ganhar a latitude de um determinado ponto da costa portuguesa.

Gago Coutinho estava convencido, de forma errónea, que a navegação através das alturas meridianas do Sol para se aferir a latitude, por intermédio do conhecimento da declinação do astro, vinha dos tempos henriquinos e que o instrumento da época era o astrolábio ao invés do quadrante. Mas estava certo ao afirmar que a navegação astronómica remontava a esse período e de que a altura meridiana do Sol era reiteradamente observada. Entendeu que o Astrolábio Náutico era, pela sua natureza, português e que as viagens das descobertas tinham sido sempre realizadas posteriormente a outras em que se estudavam os ventos e as correntes marítimas de forma a determinar latitudes e subsequentemente traçar as indispensáveis rotas marítimas. Comprovou igualmente a inexequibilidade de, em condições favoráveis, se apontarem estrelas a bordo.

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