No Liceu Gil Vicente de Lisboa, juntou-se a um notável grupo de colegas, que seriam escolhidos para a nova Faculdade de Letras da Universidade do Porto, fundada por Leonardo Coimbra em 1919. O que também acontece com Damião Peres. Atento às necessidades didácticas no ensino secundário, publicara manuais em colaboração com Manuel Paulo Merêa (1921) e com F. J. Cardoso Júnior (1923). Notável expositor – que entusiasmava os estudantes com as suas prelecções – foi o professor que marcou o ensino da História na Faculdade de Letras do Porto. Fundou e dirigiu a Revista de História da Faculdade de Letras do Porto, 1925-1927 (que foi a primeira revista universitária portuguesa de História), onde saíram artigos que depois em conjunto com escritos sobre moedas indo-portuguesas do Museu Municipal do Porto (de que elaborará o catálogo) virão reunidos em volume com o título de Estudos de História (1926). Também dirigiu o Arquivo Histórico da Cidade do Porto (1925-1927).

Logo nos primeiros escritos se mostrou o seu gosto por temas de história dos descobrimentos e da expansão portuguesa e se apresentaram dados novos a partir de investigação efectuada no Arquivo Histórico Municipal do Funchal. Também se revela desde logo o gosto pela numismática de que será reconhecido especialista.

Em 1928 fará sair 1580. O governo do Prior do Crato, pequeno livro com bom suporte documental que o revela familiar dos arquivos (Torre do Tombo e Academia das Ciências, Câmara Municipal do Porto e Simancas). Damião Peres reconstitui, quase dia a dia, desde a aclamação de D. António Prior do Crato em Santarém a 19 de Junho até ao seu exílio, a partir do Norte do País, depois de Outubro de 1580. Observa-se a triste conduta dos governadores a quem D. Henrique tinha deixado a regência, enquanto avança o Duque de Alba com as suas tropas – curiosamente pouco se trata de D. Álvaro de Bazan, futuro Marquês de Santa Cruz, sabendo-se da importância das galés neste conflito. Passa o autor em revista os momentos em que D. António procura estabelecer a sua periclitante realeza, fazendo mercês aos apoiantes, tratando da fazenda real (desvalorizando a moeda) e procurando defender-se. Com destaque para o apuramento do que foram as negociações com Felipe II com que D. António procurou sobretudo ganhar tempo. Porque foi pela força das armas que Portugal capitulou e se entregou ao Áustria de Madrid.

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