Relativamente aos conteúdos propriamente ditos, note-se uma clara predileção pela Restauração de 1640 visto haver um elevado número de artigos sobre o acontecimento: em 53 entradas, 20 incidem sobre elementos relacionados com este acontecimento, desde a pessoa de D. João IV a ocorrências da guerra, personalidades de destaque, heráldica, política monetária e financeira, situações no resto do império, etc. Tal fascínio reflete-se na mítica historiográfica que se desenvolvera em torno desta efeméride, elevada à condição de comemoração nacional numa ótica tradicionalista (Luís Reis Torgal, Ideologia política e teoria do Estado na Restauração, 1981, 22-36). A título de exemplo, vejam-se os seguintes artigos que ajudam a realçar a importância dada a este período: “O Conselho da Fazenda e as alterações monetárias no reinado de D. João IV”, de Damião Peres (1959), em que se estuda o papel da moeda nesta fase de transição política; a “Crónica inédita de D. João IV”, tratada por António Coelho (1946); “A origem do poder real e as Côrtes de 1641”, da autoria de João Francisco Aires de Campos (1942), onde se tratam questões do foro político; “A bordadura das armas nacionais e os juristas da Restauração”, do conde de S. Paio (1944), referente às origens e significado das componentes das armas nacionais; etc.

Conquanto a primeira série dos Anais dê uma maior preferência ao período da Restauração, tal não ocorre em detrimento de outros períodos e objetos de estudo. De facto, estes são abundantes e diversos na sua índole, demonstrando a transversalidade dos autores – embora se note grande presença de uma história nacionalista, sobretudo na linguagem empregue. É possível delinear uma certa importância dada ao Portugal medieval com os dois primeiros volumes a dedicarem-se exclusivamente a esse período, abordando a Batalha de Ourique e as vicissitudes a si associadas, os morabitinos, forais, crónicas e entidades jurídicas. Surgem, também, estudos sobre o Paleolítico e Mesolítico, revelando uma maior abertura temática.

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